區(qū)政府辦公室設8個內(nèi)設機構：
1.秘書一室 負責人：劉聰 電話：0730-8170566
主要負責區(qū)政府全體會議、常務會議、區(qū)長辦公會議等重要會議的組織以及會議紀要起草和有關決定的催辦落實；負責區(qū)政府、區(qū)政府辦公室召開的其它會議和活動的組織工作；承辦區(qū)政府各部門報批的會議審批工作；負責區(qū)政府領導同志的有關活動聯(lián)絡，編寫《政府紀事》；負責區(qū)政府領導同志外出請示工作和鎮(zhèn)（街道）場、區(qū)直單位行政主要負責人外出向區(qū)政府的請示報批；負責區(qū)政府、區(qū)政府辦公室領導交辦的其他工作任務。
2.秘書二室（保密室） 負責人：楊果 電話：0730-8170566
負責文電收發(fā)、處理，負責區(qū)政府、區(qū)政府辦公室有關文件的起草、審核；負責區(qū)政府印章、區(qū)長印鑒和區(qū)政府辦公室印章的使用、管理；負責區(qū)政府及辦公室文書檔案管理、機要保密工作；負責區(qū)政府、區(qū)政府辦公室領導交辦的其他工作任務。
3.總值班室 負責人： 金正球 電話： 0730-8171199
承擔區(qū)政府值班管理工作（含日常值班及節(jié)假日值班）；負責接待和督促處理群眾來信來訪；辦理上報市政府在區(qū)內(nèi)發(fā)生的突發(fā)公共事件的事項；協(xié)助區(qū)政府領導處理突發(fā)公共事件；負責區(qū)政府、區(qū)政府辦公室領導交辦的其他工作任務。
4.督查室（對外稱區(qū)政府督查室） 負責人： 肖軍輝 電話： 0730-8171476
負責國務院、省、市、區(qū)人民政府重要決定、決策貫徹落實的督查和情況綜合；負責上級人民政府和區(qū)人民政府領導重要批示、交辦事項的督辦及落實情況的反饋；負責組織對區(qū)人民政府系統(tǒng)年度工作目標的制定、進度督查和行政績效評估工作；負責省市區(qū)實事工作的督辦工作；負責區(qū)政府、區(qū)政府辦公室領導交辦的其他工作任務。
5.政工人事室 負責人：王正珍 電話：0730-8175688
負責區(qū)政府辦公室的機構編制、人事勞資等工作；負責區(qū)政府、區(qū)政府辦公室離退休人員的管理服務工作；負責區(qū)政府辦公室工會、共青團工作；負責區(qū)政府、區(qū)政府辦公室領導交辦的其他工作任務。
6.行政室 負責人： 張麗 電話： 0730-8172055
負責機關建設、管理和后勤保障工作；負責機關行政經(jīng)費預算、決算和財務開支的審核、呈報工作；負責區(qū)政府辦公室財務檔案管理；負責資料管理和報刊收訂、分發(fā)工作；負責區(qū)政府、區(qū)政府辦公室國有資產(chǎn)的賬目及實物管理；負責機關來客接待工作；負責區(qū)政府辦公室的計劃生育、婦女等工作；負責區(qū)政府、區(qū)政府辦公室領導交辦的其他工作任務。
7.金融工作室（對外稱區(qū)金融工作辦公室） 負責人：金甜 電話：0730-8172055
承擔君山區(qū)金融工作辦公室日常工作；負責貫徹執(zhí)行黨和國家金融方針、政策和法律法規(guī)，落實區(qū)委、區(qū)政府金融工作部署；根據(jù)本區(qū)國民經(jīng)濟和社會發(fā)展總體規(guī)劃，會同有關部門編制和修訂地方性金融業(yè)發(fā)展中長期規(guī)劃和工作計劃；研究分析宏觀金融形勢、國家金融政策和我區(qū)金融運行情況，及時編發(fā)君山區(qū)金融工作動態(tài)，提出改善金融發(fā)展環(huán)境，加強服務，促進發(fā)展的意見與政策建議；協(xié)助有關監(jiān)管部門整頓和規(guī)范金融秩序，協(xié)調(diào)與處理金融風險防范和化解工作，加強我區(qū)中小企業(yè)和小額擔保公司信用體系建設，維護金融業(yè)的穩(wěn)定發(fā)展；負責政府、政府職能部門及當?shù)仄髽I(yè)與金融機構的日常聯(lián)系和合作，做好配合、協(xié)調(diào)、考評和信息交流工作，實現(xiàn)政銀、銀企的共同發(fā)展；協(xié)助、配合金融監(jiān)管機構加強對各類金融機構的監(jiān)管，協(xié)調(diào)地方金融資源的優(yōu)化配置，強化地方財政注入資金的監(jiān)管，大力推進地方金融機構的改革；負責全區(qū)融資性擔保機構和民營貸款公司的監(jiān)督管理、設立、資格初審、備案、變更、退出等工作；進一步改善金融發(fā)展環(huán)境，推動我區(qū)投融資體制改革，開辟各種融資渠道，協(xié)調(diào)金融機構加大對全區(qū)重點項目建設、“三農(nóng)”服務、中小企業(yè)、再就業(yè)等一系列貸款的扶持力度；負責區(qū)政府、區(qū)政府辦公室領導交辦的其他工作任務。
8.禁毒辦（對外稱區(qū)禁毒委員會辦公室）負責人：彭與福 電話：0730-8173186
制定全區(qū)禁毒工作規(guī)劃并組織實施；制定簽訂年度禁毒工作責任書，督促落實禁毒工作責任制，對各鎮(zhèn)（街道）場、禁毒委成員單位責任書執(zhí)行情況進行檢查考核；開展禁毒調(diào)查研究，及時分析掌握全區(qū)毒情動向和工作進展情況，提出建設性的工作對策和建議；組織開展全區(qū)禁毒宣傳和毒品預防教育工作，指導禁毒志愿者隊伍建設和工作的開展；組織、指導全區(qū)禁吸戒毒工作；協(xié)調(diào)、督促、指導有關行業(yè)部門，嚴格對精神藥品、麻醉藥品和易制毒化學品的管理，防止流入非法渠道；組織、指導禁種鏟毒工作；負責禁毒專項經(jīng)費、裝備的計劃和管理；承辦區(qū)禁毒委和上級業(yè)務部門交辦的其他事項。
機關黨支部按章程設置，負責群團、離退休干部和關心下一代工作。